Zhekin
Из под Windows отдельную систему с отдельным загрузчиком не поставить. Нужно ставить с нуля, загрузившись прямо с установочного CD. Также Bios должен поддерживать с какого HDD грузиться (нужно перед установкой XP выбрать приоритет второго HDD).
Также чистая XP не будет устанавливаться на SATA HDD, подключённый к контроллеру в режиме AHCI, для этого нужны драйвера на контроллер SATA. Можешь попробовать установить в этом случае одну из сборок XP с уже встроенными драйверами, например, вот эту:
https://forum.simplix.ks.ua/viewtopic.php?id=15
(Ссылки на закачку есть в теме, также в ней хорошо описан состав этой сборки). Ещё как вариант - сделать образ работающей системы (образ всего раздела) акронисом и накатить его на второй HDD, будет такая же система с отдельным загрузчиком, выбирать систему также через Bios, приоритет загрузки HDD-0, HDD-1.